Justice League blir oavsiktligt transporterade till en parallell värld och möter Justice Guild of America, seriefigurer i Justice Leagues värld. Medan de bekämpar superskurkar i den här dimensionen upptäcker de att den bara är en illusion, ett levande minne från en civilisation som förstördes för 40 år sedan.

Justice League återvänder från ett uppdrag i rymden och upptäcker att världen har blivit omformad – ett resultat av att skurken Vandal Savage gett information till sitt yngre jag under 1940-talet, vilket lät honom ta över världen under Andra världskriget. Hjältarna reser själva tillbaka i tiden för att stoppa honom, och slåss mot nazisterna tillsammans med DC Comics hjältar från Andra världskrigets era (inklusive Easy Company, Blackhawk och Steve Trevor).

Wonder Woman bekantar sig med prinsessan av Kasnia, en resande partyflicka som är ovillig att avsluta sina vilda sätt för att gifta sig. Olyckligtvis är hennes fästman den odödlige Vandal Savage, och han har redan planer för både tronen och Justice League. Det är upp till Wonder Woman och Batman att stoppa Savage medan Flash, Green Lantern och Jonn Jonzz går för att slå ut Savages nya railgunsatellit.

Efter Flashs död startar Justice Lords en attack mot Vita Huset, där Stålmannen dödar president Lex Luthor. Två år senare regerar Justice Lords planeten med järnhand. Batman upptäcker dimensionen där Justice League bor. De finner sina motsvarigheter naiva, men med en önskan att styra den nyligen upptäckta världen reser de dit och fångar Justice League i ett kraftfält. De tar sedan över deras platser i en strävan att göra denna jord likadan som sin egen.

Ett gäng superskurkar slår sig ihop för att ta hämnd på Stålmannen. När de attackerar Metropolis skjuter Toyman från ett experimentellt vapen mot Batman och den skadade Wonder Woman, men Stålmannen offrar sig själv för att rädda de andra och blir till synes förintad. Ligan försöker hantera förlusten av Stålmannen genom att försvara Metropolis i hans frånvaro. Så småningom kommer Lobo till vakttornet och utropar sig till Stålmannens ersättare, men gör mer skada än nytta. Stålmannen vaknar 30.000 år in i jordens framtid, och är maktlös eftersom solen har blivit röd. Han får hjälp av Vandal Savage, som är den enda människa kvar i livet till följd av ett försök till världsherravälde iscensatt ett par månader efter Stålmannens försvinnande.

Efter att ha tagit över en TV-station i Las Vegas meddelar Jokern att han har placerat ett flertal bomber som kommer att förstöra Strip om 22 minuter och 51 sekunder om de inte stoppas av Justice League. Med hela världen som tittar på Jokerns sändning måste hjältarna först ta sig förbi Jokerns eget superlag, Royal Flush Gang. Men hotet som iscensatts av Jokern är inte så simpelt som det verkar, och Batman måste spåra hans tillflyktsort för att stoppa sin ärkefiende.

Efter att ha räddat två världar beslutar sig medlemmarna i Justice League för att ta en paus för att fira jul. Flash tillbringar sin jul med en grupp barn på ett barnhem, som ber honom att hitta en särskild leksaksanka till dem som julklapp. Den populära leksaken blir förstörd av Ultra-Humanite, som så småningom bestämmer sig för att hjälpa Flash. Green Lantern och Hawkgirl visar varandra hur de brukar fira julen. Lantern deltar i ett snöbollskrig med Hawkgirl. Hawkgirl återgäldar genom att starta ett interplanetariskt krogbråk. Batman tillbringar sin jul med att sitta vakt i vakttornet. Wonder Woman nämns inte alls. Under tiden bjuder Stålmannen över J'onn till Smallville för en julaftonskväll med sina adoptivföräldrar. Även om J'onn till en början känner sig obekväm lär han sig så småningom att njuta av julen.

Efter att jorden invaderats av ett gordanianskt krigsskepp får hjältarna hjälp av en armé hawkmen från Hawkgirls hemplanet Thanagar. Thanagarianerna erbjuder sig att hjälpa jorden att bygga en sköld för att skydda den från gordanianerna, men Batman upptäcker att detta bara är ett knep. Hawkgirl slits mellan sin trohet till Thanagar och sitt åtagande för Justice League, liksom mellan sin trolovning till den thanagarianiska befälhavare Hro Talak och sin spirande kärlek till Green Lantern, John Stewart.

Hjältarna utökar sin organisation genom att värva nya medlemmar från hela världen. Den nyaste av dessa är Green Arrow, som upprepade gånger har avstått från att besvara inbjudan att gå med i gruppen. Han förs till det utbyggda, och mycket större, vakttornet via teleport. I motviljan att gå med liftar han med Green Lantern, Captain Atom och Stålflickan tillbaka till jorden. De har sänts ut på ett uppdrag att stoppa en jättelik, okontrollerad, atomdriven försvarsrobot i ett namnlöst asiatiskt land som existerar i en självpåtagen internationell isolering.

Batman och Wonder Woman finner Stålmannen som fånge hos Mongul i Fortress of Solitude, och han drömmer om ett idylliskt liv på Krypton, vilket är en vision han fått av en parasitisk planta som kallas Black Mercy.

Morgaine le Fey förvandlar Stålmannen, Batman, Wonder Woman och Green Lantern till åttaåringar efter att Mordred använt sin magi för att förflytta alla vuxna från jorden och endast låta barnen få vara kvar.

Wonder Woman samarbetar med två bröder med superkrafter, Hawk och Dove, för att stoppa Ares planer att eskalera ett europeiskt inbördeskrig genom att släppa ut en krigsmaskin som kallas Annihilator i striden.

Den månghundraåriga häxmästarinnan Circe förvandlar Wonder Woman till en gris som hämnd mot Dianas mor. Batman och Zatanna jobbar tillsammans för att göra henne normal igen medan B'wana Beast försöker hitta "Wonder Pig" innan hon slaktas på ett slakteri. Det innehåller den berömda scenen där Batman sjunger jazzsången "Am I Blue?" inför publik på en nattklubb.

Justice League möter Ultimen, en populär grupp unga hjältar. Ultimen upptäcker att de är ett resultat av regeringens experiment med att skapa supermänniskor, och endast har en kort stund kvar att leva. I frustration och ilska strider de alla utom Long Shadow mot Justice League.

Tre högskoleungdomar återupplivar av misstag Solomon Grundy, vilket får honom att vakna upp mer kraftfull än någonsin, men utan något minne av sitt förflutna. Dr. Fate, Amazo, Aquaman och Shayera hjälper Justice League-medlemmarna att stoppa hans framfart.

Batman, Wonder Woman och Green Lantern jagar Chronos till dåtiden, där de slår ihop sig med några av de största DC-hjältarna i Vilda västern från den tiden. Efter att ha övervunnit stulen framtidsteknologi i den eran följer de Chronos till framtiden. Warhawk från Batman Beyond-eran visar sig vara Green Lantern och Hawkgirls son.

Batman, Green Lantern och Wonder Woman jagar Chronos till det framtida Gotham City (Batman Beyond-eran) precis i tid för en strid med jokrar tillsammans med den tidens Justice League. Tidsresenärerna förs till Justice League Unlimiteds gömställe. En äldre Bruce Wayne berättar att gatugänget de slogs mot utökades med Chronos som ledde dem till att döda resten av Justice League från den tiden. De kombinerade hjältarna besegrar de omformade jokrarna, och Batman fångar Chronos i en tidsloop.

I Batman Beyonds framtid avslöjar Amanda Waller för den äldre Terry McGinnis att hon skapade projektet Batman Beyond för att fortsätta Bruce Waynes arbete.

Efter att Lex Luthor rymt från fängelset får Gorilla Grodd honom att gå med i det nya Secret Society med en del av Brainiacs teknologi. Luthor, Key och Doctor Polaris stjäl Longinus spjut från Blackhawk Island, trots Flash, Fire (i vilken Flash är förälskad), Shayera och den siste överlevande Blackhawks ansträngningar att stoppa dem.

Stålflickan, Stargirl, S.T.R.I.P.E. och Green Lantern hjälper Warlord att frigöra Skartaris (en gömd värld inne i jordens kärna) från Deimos, en brutal diktator, medan de skyddar en stor bit kryptonit från Metallo och Silver Banshee.

Wonder Woman försvarar vikingaprinsens kropp från Legionagenter som vill åt den för att kunna skapa osårbarhetskrafter. Bekymrad över sin isolering lämnar J'onn Justice League för att bättre kunna förstå mänskligheten.

Orion försöker förstå Flashs upptåg när Wally West och Batman slåss mot fyra av Flashs fiender från dennes skurkgalleri som attackerar museet som öppnats till Flashs ära. Även om museet blir totalförstört visar det sig vara en bra dag enligt Flash.

General Wade Eiling från Cadmus stjäl Captain Nazis supersoldatserum och injicerar sig själv med det för att "skydda" världen från metahumaner. Med de mest kraftfulla medlemmarna ur Justice League upptagna leder Green Arrow Stargirl, S.T.R.I.P.E., Shining Knight, Crimson Avenger, Vigilante och Speedy en kamp mot honom. Eiling stannar upp strax innan han dödar Shining Knight när invånare påpekar att Eilings anledning att attackera hjältarna är obefintlig, då hela hans syfte med attacken var att befria världen från metahumaner, och han var den ende där med superkrafter.

Roulette startar om Metabrawl, den här gången med en kvinnlig kampföreställning ("Glamour Slam") som utgörs av sinneskontrollerade Justice Leaguer-medlemmar. Först blir Huntress och Black Canary uppsatta mot Vixen och Hawkgirl, och sedan måste de fyra slåss mot Wonder Woman.