Primera B de Chile 2009 var den näst högsta serien i fotboll i Chile för säsongen 2009. Serien var uppdelad i två mästerskap, Torneo Apertura och Torneo Clausura. Varje lag spelade 19 matcher i vardera mästerskap, vilket innebar totalt 38 matcher för varje lag. Vid säsongens slut slogs mästerskapen ihop och vinnaren av den sammanlagda tabellen, denna säsong Unión San Felipe, gick upp i Primera División. Utöver det så möttes vinnarna av respektive mästerskap i playoff för att spela om andraplatsen, och därmed en direktplats upp till den högsta divisionen. Eftersom Unión San Felipe vann Torneo Apertura gick playoff-platsen till tvåan i mästerskapet, Santiago Wanderers, som fick möta vinnaren av Clausura, San Luis. Santiago Wanderers vann och gick således direkt upp till Primera División, medan San Luis tog en av de två möjliga kvalplatserna. Den andra kvalplatsen gick till det näst bästa valbara laget i den sammanlagda tabellen, vilket var San Marcos de Arica. Det lag som kom sist i den sammanlagda tabellen skulle flyttats ner, men eftersom Deportes Melipilla degraderades på grund av ekonomiska problem så flyttades inget lag ned på sportsliga grunder.
Alla lag mötte varandra en gång vardera, vilket innebar totalt 13 matcher. Därefter spelade varje lag mot sex andra lag en gång vardera, vilket gav ytterligare 6 matcher och således totalt 19 matcher.
Alla lag mötte varandra en gång vardera, vilket innebar totalt 13 matcher. Därefter spelade varje lag mot sex lag en gång vardera, vilket gav ytterligare 6 matcher och således totalt 19 matcher.
Vinnaren av den sammanlagda tabellen flyttades upp direkt. Utöver det möttes vinnarna av Torneo Apertura (i detta fall tvåan då vinnaren av Apertura även vann den sammanlagda tabellen) och Torneo Clausura i en playoff-match för direkt uppflyttning. Förloraren gick till uppflyttningskval tillsammans med det bäst placerade valbara laget utöver dessa. Lota Schwager fick 3 poängs avdrag, Deportes Concepción 6 poängs avdrag och Deportes Melipilla 21 poängs avdrag; alla för försenade löneutbetalningar. Dessutom blev Deportes Melipilla nedflyttade på grund av ekonomiska problem (så det sist placerade laget flyttades inte ner).
San Luis och San Marcos de Arica fick möta Curicó Unido respektive Palestino från Primera División. San Luis och Palestino vann och spelade således Primera División 2010, medan Curicó Unido och San Marcos de Arica fick spela i Primera B 2010.