* Antal matcher och mål i seniorlag räknas endast för de inhemska ligorna och är korrekt per den 21 oktober 2024. ** Antal landskamper och mål är korrekta per den 2 april 2024.
Beqiri har spelat ungdomsfotboll i IFK Göteborg. I januari 2024 meddelade IFK Göteborg att Beqiri var tillgänglig för spel i samarbetsklubben Västra Frölunda IF under säsongen 2024.[1] Han debuterade den 28 mars och gjorde två mål för Västra Frölunda i en 3–2-vinst över Landvetter IS i division 2.[2] Fyra dagar senare, den 1 april, gjorde Beqiri allsvensk debut för IFK Göteborg då han blev inbytt i den 87:e minuten i en 4–1-förlust mot Djurgårdens IF.[3]