CAF:s kvalspel till världsmästerskapet i fotboll för herrar 2006 började med playoff 10 oktober 2003 och avslutades med en sista gruppspelsmatch 9 oktober 2005. Kvalet spelades för att få fram de fem lag som skulle representera Caf, den afrikanska fotbollskonfederationen, i VM 2006 i Tyskland. Tävlingen användes också för att få fram de 16 lag som skulle delta i afrikanska mästerskapet 2006. 51 av CAF:s då 52 medlemmar deltog, endast Djibouti valde att avstå.
Av de 51 deltagande nationerna var de fem som deltog i VM-slutspelet 2002 direktkvalificerade till gruppspelsomgången tillsammans med de 4 högst rankade av de kvarvarande lagen. Övriga 42 lag spelade ett playoff, dubbelmöten, om resterande 21 platser.
De 42 nationer som behövde kvala via playoff delades in i fyra stycken seedningsgrupper efter respektive nations placering på Fifas världsranking för herrar (per den 25 juni 2003) där lag från seedningsgrupp A lottades mot lag från seedningsgrupp D, och lag från seedningsgrupp B mot grupp C. Vinnaren i varje möte gick vidare till gruppspelsomgången.
Matcherna spelades 10, 11 och 12 oktober samt 14, 15, 16 och 19 november.
De 30 nationerna som kvalificerats för gruppspelsomgången delades in i fem grupper om sex lag vardera. Inför lottningen hade alla lagen placerats i seedningsgrupper, där de fem nationer som deltog i VM 2002 hamnade i seedningsgrupp A, medan övriga nationers seedningsgrupp baserades på världsrankningen per den 19 november 2003. Lag i samma seedningsgrupp kunde inte lottas in i samma grupp.[källa behövs]
Vinnaren i varje grupp kvalificerades för VM-slutspelet och lag på plats 1–3 kvalificerades för afrikanska mästerskapet. Då Egypten hamnade på tredje plats i sin grupp kvalificerades även lag 4, Libyen, i den gruppen, då Egypten var direktkvalificerat till afrikanska mästerskapet som värdar.
Marocko var en av endast tio nationer i VM-kvalet världen över som gick obesegrade genom hela kvalet, och den enda afrikanska nationen som svarade för den bedriften. Ändå kvalificerade de sig inte för VM.
Togo hade den yngsta medelåldern av de 31 lagen som kvalade in till VM. Togos spelare hade en snittålder på 22 år och 4 månader.
Totalt förekom 1 457 spelare i de olika nationernas laguppställningar under VM-kvalet.
Totalt gjordes det 506 mål i det afrikanska VM-kvalet, vilket motsvarar ett snitt på 2.66 mål per match, näst minst av alla konfederationer, bara det sydamerikanska kvalet var målsnålare.
Angola var också det totalt målsnålaste laget som kvalificerade sig för VM med ett snitt på 1,25 mål per match.
Totalt gjordes 332 av de 506 målen på hemmaplan och 174 på bortaplan.
Togos Adebayor var bäste målskytt i kvalet med elva mål.
CAF var den konfederation som totalt lockade näst flest åskådare på VM-kvalmatcherna med totalt 4 995 187 personer i publiken, bara UEFA med 5 825 195 var bättre. Gällande snittet var CAF:s 26 290 näst bäst, bara CONMEBOL:s 33 750 var bättre. Den match som lockade allra flest åskådare var Kongo-Kinshasa mot Sydafrika med 85 000 åskådare i Kinshasa. Det var tredje bäst sett till hela världens VM-kvalmatcher. Kongo-Kinshasa var också den nation i hela världen som lockade mest publik i snitt på sina hemmamatcher, hela 79 000.